基于分子大小的蛋白质分离

2024-07-15

聚丙烯酰胺凝胶通过丙烯酰胺与双丙烯酰胺(甲叉)的反应形成,产生高度交联的凝胶基质。凝胶充当筛子,蛋白质在电场作用下通过这个筛子。蛋白质总体带正电或负电,这使得蛋白质分子能够朝向等电点移动,在等电点分子没有净电荷。通过使蛋白质变性并赋予它们均匀的负电荷,可以在它们向正电极迁移时基于它们的大小分离它们。

实验方案

所需电源、玻璃板、垫片和点样梳的垂直电泳室。

试剂:

产品编号 产品名称 质量规格 成分(编号)
PS0008 丙烯酰胺/甲叉溶液 30%,29:1 A60072/M70194
PS0128 SDS-PAGE分离胶缓冲液 T10006 pH8.8
PS0129 SDS-PAGE/Tris-HCL-SDS 浓缩胶缓冲液 T10006 pH6.8
PS0726 Laemmli加样缓冲液 B10058/M50011/G20009/S20016/T10006
PS0131 Tris-甘氨酸电泳缓冲液 10× T10006/G10012/S20002
PS0356 SDS 10% S20002
PS1137 SDS 10% A30002
T20005 TEMED 电泳级 -

制备凝胶

用去离子水和乙醇清洁凝胶浇注装置的玻璃板和垫片。

将玻璃板和垫片组装在稳定、平整的表面上。

根据所需凝胶的百分比,使用以下体积制备分离胶溶液(制成体积为10 mL)。

凝胶% 水 (mL) 30% 丙烯酰胺 (mL) 分离胶缓冲液 10% SDS (µL) 10% APS (µL) TEMED*(µL)
8% 4.6 2.6 2.6 100 100 10
10% 3.8 3.4 2.6 100 100 10
12% 3.2 4.0 2.6 100 100 10
15% 2.2 5.0 2.6 100 100 10
* TEMED必须最后添加

将凝胶溶液倒入组装了垫片的玻璃板中。为了使分离凝胶表面保持均匀和水平,用水或异丙醇(I20020)间隔表面。

让凝胶在室温下凝固约20-30分钟。

使用以下体积制备浓缩胶溶液(制成体积为10 mL):

凝胶% 水 (mL) 30% 丙烯酰胺 (mL) 浓缩胶缓冲液 10% SDS (µL) 10% APS (µL) TEMED*(µL)
5% 5.86 1.34 2.6 100 100 10
* TEMED必须最后添加

丢弃分离胶上的水。

加入5%浓缩胶溶液直至溢出。立即插入点样梳,确保凝胶中或梳齿周围没有气泡。

让凝胶在室温下凝固约20-30分钟。

样品制备

在一定体积的蛋白质样品(细胞或组织裂解液)中,加入等体积的上样缓冲液。

将上述混合物在95°C下煮沸5分钟,16000G离心5分钟。

这些样品可以在-20°C下储存,也可以用于进行凝胶电泳。

凝胶染色

考马斯蓝染色:用考马斯亮蓝G-250(PS0109)染色蛋白质凝胶是显示通过SDS-PAGE分离的蛋白质的常用方法。它非常灵敏,适合长期储存凝胶。

试剂

产品编号 产品名称 成分(编号)
PS0630 聚丙烯酰胺凝胶固定液 M20001/A20002/超纯水
PS01019 考马斯亮蓝快速染色液 E20003/A20002/C70031/HCL/超纯水
PS0107 常规考马斯亮蓝染色洗脱液 E20003/A20002/超纯水
PS1222 凝胶储存溶液 A20002/超纯水

操作流程

电泳后,将凝胶放入含有凝胶固定溶液的塑料托盘中。将托盘放在摇床上固定蛋白质2小时。

丢弃凝胶固定溶液,然后加入考马斯溶液。 放在摇床上,将凝胶染色2-4小时。

染色步骤后,用蒸馏水洗涤凝胶数次,以去除多余的染料。

将脱色溶液添加到凝胶。放在摇床上脱色约4个小时,直到可以看到清晰背景上的清晰蓝色条纹。

脱色后,可将凝胶储存在凝胶储存溶液中,并根据需要拍照。

银染

操作流程

电泳后,将凝胶浸入固定溶液40分钟。在固定溶液中浸泡过夜能产生更清晰的背景。

丢弃固定溶液,用30%乙醇溶液洗涤凝胶10分钟,然后用超纯水洗涤10分钟。

倒出水,并将凝胶在敏化剂溶液中孵育10分钟。

丢弃敏化剂溶液,用水洗涤凝胶两次,每次洗涤持续10分钟。

倒出水,并将凝胶浸泡在银溶液中10分钟。

倒掉银溶液,并在水中洗涤凝胶1.5分钟。

倒掉水,将凝胶浸入显影液中3至7分钟。

向显影液中加入5 mL终止液,孵育5分钟。丢弃显影液/终止液,在超纯水中洗涤凝胶15分钟。

这时凝胶可以拍照,也可以储存在新鲜的超纯水中。

双重染色:使用考马斯亮蓝对凝胶进行染色,然后使用上述步骤进行银染色。

铜染色

为了确认蛋白质的迁移和分离,凝胶可以用可逆染色剂(如CuCl2)染色。

试剂:

0.3 M CuCl2溶液

0.25 M Tris和0.25 M EDTA溶液

操作流程

将电泳后的凝胶用蒸馏水冲洗最多30分钟。

将凝胶浸入0.3 M CuCl2溶液中10分钟。

用去离子水冲洗。

蛋白质可以在蓝色背景上显示为清晰的区域。

脱色:反复在0.25 M Tris和0.25 M EDTA溶液(pH 9)中洗涤染色的凝胶。

在进行后续的转印操作之前,将脱色后的凝胶转移至转印缓冲液中。