DNA提取试剂盒?

2024-07-15

 

核酸与蛋白质等大分子向固相支撑膜的转移称为印迹。通过凝胶电泳分离的DNA和RNA分子的片段分别在称为Southern和Northern印迹的过程中转移到尼龙或硝酸纤维素膜上。Southern印迹由Edwin Southern于1975年推出,是一种检测DNA样品中特定DNA序列的方法。基于该方法出现的其他印迹技术被称为Northern印迹(用于RNA)、Western印迹(用于蛋白质)、Eastern印迹(用于翻译后蛋白质修饰)和Southwestern印迹(用于DNA-蛋白质相互作用)。

Southern和Northern印迹实验方案包括以下主要步骤:

DNA/RNA的纯化:从细胞或组织来源中提取和纯化DNA/RNA。

消化DNA:用限制酶把DNA消化成片段。RNA不需要该步骤。

凝胶电泳:在琼脂糖凝胶上分离DNA片段。RNA样品可以在琼脂糖凝胶上用甲醛分离,甲醛作为限制RNA分子二级结构的变性剂。

转膜:将DNA/RNA片段从凝胶转移到尼龙膜上。

预杂交(封闭):用含有鲑鱼精子DNA的预杂交溶液清洗尼龙膜,以封闭非特异性DNA相互作用并降低背景噪音。

探针的制备:准备新的探针DNA并用32Pα标记的dCTP标记。

杂交:用标记的探针孵育印迹。

探针的检测:在-80°C下曝光胶片,检测探针和目标DNA/RNA序列。

DNA/RNA印迹操作程序中的步骤

Southern印迹实验方案

材料

—用于DNA分离和纯化的试剂

—用于限制性消化DNA的试剂

琼脂糖凝胶电泳的试剂和缓冲液

—琼脂糖凝胶电泳仪

—Whatman滤纸

—纸巾

—带正电荷的尼龙膜

鲑鱼精子DNA

—杂交管

—X光胶片

缓冲液

—10X TBE,用于凝胶电泳。对于较大的DNA片段,可以使用TAE缓冲液代替TBE。

—20X SSPE,用作预杂交和转膜缓冲液。在类似的印迹实验方案中,可以使用20X SSC()代替SSPE。

—变性溶液,用于使dsDNA变性,以使其与探针结合。

—中和溶液,用于在变性dsDNA后中和凝胶。

—Denhardt溶液,在预杂交过程中用于封闭非特异性DNA杂交。

—2X预杂交溶液,用于准备探针杂交所用的膜。

—1X探针缓冲液,用于探针混合物。(现制备,100μL,1 M TRIS,pH 7.6 50μL,2 M MgCl2 5μL,0.5 M DTT 10μL,水35 μL)

—1X探针混合物(27μL,探针缓冲液 2.7μL ,寡核苷酸探针(0.2μg/μL)2μL,T4磷酸核苷酸激酶(PNK)1μL,水11.3μL ,32P-ATP 10 µL)

—6X低苛性洗涤溶液,用于去除低同源性杂交并降低背景噪音。(600 mL洗涤溶液,20X SSPE 180 mL,10% SDS 12 mL,水408 mL。)

—1X高苛性洗涤溶液,用于去除紧密同源杂交,并进一步降低背景噪音。(600 mL洗涤溶液,20X SSPE 30 mL,10% SDS 12 mL,水558 mL。)

DNA分离

 

—通用型DNA提取试剂盒(PS1356)

—植物基因组DNA提取试剂盒(PS1357)

—多糖多酚植物基因组DNA提取试剂(PS1358)

真菌基因组DNA提取试剂盒(PS1359)

—酵母基因组DNA提取试剂盒(PS1360)

—细菌基因组DNA提取试剂盒(PS1361)

—病毒基因组DNA/RNA提取试剂(PS1362)

—土壤基因组DNA试剂盒(PS1363)

—粪便基因组DNA提取试剂(PS1364)

—海洋动物基因组DNA提取试剂盒(PS1365)

游离核酸DNA中量提取试剂盒(PS1366)

—微量/临床基因组DNA快速提取试剂盒(PS1367)

—柱式血液基因组DNA小量提取试剂盒 (0.1-1ml)(PS1368)

—非柱式血液基因组DNA小量提取试剂盒(0.1-1ml)(PS1369)

—唾液DNA提取试剂盒(PS1370)

口腔拭子基因组DNA提取试剂盒(PS1371)

新型固定组织基因组DNA提取试剂盒(PS1372)

—DNA/RNA/蛋白共提试剂盒(PS1373)

详细实验方案请登陆http://www.jm-bio.com查看说明书。

限制性酶切

用适当的限制性酶在37 °C消化DNA 2-24 h。如果DNA样品是克隆衍生产物,则1-2小时的消化时间就足够了。对于基因组DNA,通常需要用过量的酶(5-10X)孵育过夜。

如有必要,使用乙醇沉淀法浓缩消化的DNA。在凝胶上分离之前,必须完全除去痕量乙醇。

凝胶电泳

在琼脂糖凝胶上溶解消化的DNA。TAE应该用于较短时间的运行(<4小时)和较大的DNA片段,而TBE应该用于较长时间的运行(> 4小时)和较小的DNA片段(<1kb)。用溴化乙啶染色凝胶,并使用UV透照仪获得凝胶图像。如果在电泳之前将溴化乙啶掺入琼脂糖中,则可以在运行后立即获得凝胶图像。因为溴化乙啶的毒性,我们提供无毒核酸染料红色(PS0533,10000× in DMSO;PS1223,10000× in H2O)和绿色(PS1183,10000× in H2O)

转膜

在转膜步骤中,来自电泳凝胶的DNA(或RNA)将被转移到尼龙膜上,以使探针易于杂交和检测。

—将凝胶转移到含有变性溶液的托盘中,溶液要足以完全覆盖凝胶。用这种溶液洗涤凝胶两次,每次洗涤在摇床上持续25分钟。

—用水冲洗凝胶两次。

—用中和溶液洗涤凝胶两次,每次洗涤在摇床上持续15分钟。

—用水冲洗凝胶两次。

—用20X SSPE在摇床上洗涤凝胶30分钟。

—在上述步骤中,准备用于转膜步骤的Whatman纸和膜。

—切下一条尼龙膜,将其浸泡在水中。切下一条比凝胶宽的Whatman纸,将其浸泡在10X SSPE缓冲液(转膜缓冲液)中。

—切下三条几乎与凝胶大小相同的Whatman纸。

—切下数张几乎与凝胶大小相同的纸巾。

—在含有10X SSPE的托盘上放置一个稳定的平台。

—在平台上放一张saran保鲜膜。在saran保鲜膜上,放一张浸有10X SSPE的Whatman纸。用玻璃棒在它们上面滚动,以把气泡撵出。确保Whatman纸的边缘接触托盘中的—SSPE缓冲液。这张Whatman纸将充当芯子,将SSPE缓冲液向上吸并穿过凝胶,以在尼龙膜上沉淀DNA条带。

—将凝胶面朝下放在湿润的Whatman纸上。将膜放在凝胶上面。用玻璃棒在它们上面滚动,以把气泡撵出。

—在膜上放置三层Whatman纸。用玻璃棒在它们上面滚动,以把气泡撵出。

—在这上面放一叠纸巾,然后放上重物(如玻璃板)。

—让这个组装静置过夜,以完全转移DNA片段。将不超过15kb的DNA片段转移大约需时18小时。

—转移完成后,将印迹放入自动设置的UV交联机中。进行UV交联以使DNA或RNA与尼龙膜共价键合,这在检测期间增强杂交信号。另一个选择是在转膜后烘干膜,这使—核酸与膜之间形成非共价的半永久键合。DNA不能与硝酸纤维素膜进行UV交联,只能烘烤。

预杂交(封闭)

—预杂交(也称为封闭)步骤的作用是最大限度地减少探针对尼龙膜的非特异性附着。鲑鱼精子DNA(D10069)通常用作封闭剂,用来防止探针粘附到膜上,确保它只与已经转移到膜上的目标DNA条带相互作用。

杂交

DNA的互补链(探针)用于检测应存在于膜上的目标序列。来自两种不同来源的DNA组合形成“杂合”dsDNA,但前提是这两条链是同源的。

—制备1X探针混合物,在37°C水浴中孵育40分钟。

—让探针混合物通过G-25 Sephadex柱,以去除游离标记(未掺入的探针)。

—用液体闪烁法确定探针的特异活性。

—将10 mL杂交溶液加热至49°C,向其中加入10-15 X6 cpm的探针,并充分混合。

—将印迹中的预杂交溶液丢弃;在标记的探针中添加杂交溶液。49°C孵育过夜。

—将6X洗涤溶液温热至49°C。将印迹中的杂交溶液丢弃,添加6X洗涤溶液。

—将6X低苛性洗涤溶液加热至49°C。将印迹中的杂交溶液丢弃,添加6X洗涤溶液。低苛性洗涤去除低同源性杂交,以留下高同源性杂交,从而精炼目标DNA样品。

—制备1X高苛性洗涤溶液,并将其加热至49°C。将印迹洗涤约30秒并丢弃洗涤溶液。该步骤使用高苛性溶液去除紧密同源的杂交,以进一步精炼目标DNA。

—使用盖革计数器检查印迹的活性。如果每秒有10-50条具有照射峰值的条带,就是理想的结果。如果背景太高,则用1X洗涤溶液再次清洗印迹。

检测探针

—将印迹放入衬有新的saran保鲜膜的暗盒中,小心地将印迹包好,确保印迹和保鲜膜之间没有气泡。

—将暗盒放入暗室,将X光胶片放在印迹上。锁上暗盒,将其置于-80 °C过夜。在第二天显影。

—可将另一张X光片放在印迹上,并放回-80 °C进行另一次曝光。

NORTHERN印迹实验方案

Northern印迹实验方案类似于Southern印迹实验方案,只是RNA序列是在掺入甲醛的变性琼脂糖凝胶上分离。

RNA分离

哺乳动物细胞或组织和使用总RNA提取试剂。

为了确定RNA的质量和浓度,分别在260 nm和280 nm处读取样品的吸光度。吸光度比值A260/A280为 1.8-2.1 表示 RNA的质量较好。

我们提供多款总RNA提取试剂

—产品编号PS0808,适用范围广泛,可以从动物组织、 植物材料、 各种微生物及培养细胞等样品中提取总RNA。

—产品编号PS1175,是一款免氯仿的RNA提取试剂。与传统 Trizol 提取方法相比,本产品不需要使用氯仿进行分层,操作更简单,且全程可在常温进行。

—产品编号PS1225,本产品更适合和血液的提取RNA。

凝胶电泳

—DNA琼脂糖凝胶电泳使用移液器将样品小心地加入孔中。如果需要,也可加入含有各种大小 RNA 片段(R7020, R7644)的适当标记物。

—琼脂糖凝胶电泳使RNA变性。

转膜

转膜设置、预杂交、杂交和检测的实验方案与Southern blotting相同。

 

产品推荐

产品编号 产品名称 质量标准
A60072 丙烯酰胺 ≥99%,电泳级
C10071 酪蛋白钠 来源于牛奶 90%(dried basis)
PS0635 Denhardt's Solution 50×
D10069 脱氧核糖核酸 钠盐 单链
P10033 聚蔗糖400 BR
PS1356 通用型DNA提取试剂盒 -
PS1357 植物基因组DNA提取试剂盒 -
PS1358 多糖多酚植物基因组DNA提取试剂 离心柱法
PS1359 真菌基因组DNA提取试剂盒 -
PS1360 酵母基因组DNA提取试剂盒 -
PS1361 细菌基因组DNA提取试剂盒 -
PS1362 病毒基因组DNA/RNA提取试剂 -
PS1363 土壤基因组DNA试剂盒 -
PS1364 粪便基因组DNA提取试剂 -
PS1365 海洋动物基因组DNA提取试剂盒 -
PS1366 游离核酸DNA中量提取试剂盒 -
PS1367 微量/临床基因组DNA快速提取试剂盒 -
PS1368 柱式血液基因组DNA小量提取试剂盒 (0.1-1ml) -
PS1369 非柱式血液基因组DNA小量提取试剂盒(0.1-1ml) -
PS1370 唾液DNA提取试剂盒 -
PS1371 口腔拭子基因组DNA提取试剂盒 -
PS1372 新型固定组织基因组DNA提取试剂盒 -
PS1373 DNA/RNA/蛋白共提试剂盒 -
PS1352 变性溶液
PS1355 杂交溶液 2×,用于Northern and Southern blotting
PS0538 MESA buffer 10×
PS1353 中和溶液
P10014 聚乙烯吡咯烷酮 K30,平均分子量40000
PS1354 预杂交溶液 2×,用于Northern and Southern blotting
PS0573 SSC缓冲液 20×,pH:7.0
PS0574 SSPE缓冲液 20×,pH:7.4
PS0808 总RNA提取试剂 -
PS1175 总RNA提取试剂 免氯仿
PS1225 总RNA提取试剂 LS -
PS0619 TAE缓冲液 50×
PS0397 TBE缓冲液 50×
A10065 琼脂糖 EE0≤0.5%
F50008 甲醛溶液 分子生物学级,≥36% in H20,含10%-15%的甲醇稳定剂
PS1223 核酸染料red 10000× in H2O
PS0533 核酸染料red 10000× in DMSO
PS1183 核酸染料Green 10000× in H2O
E60004 溴化乙啶 分子生物学级
PS0970 RNA上样缓冲液
P10132 派洛宁Y Dye content ≥50%
B10010 溴酚蓝 IND
X70002 二甲苯青FF 生物技术级
PS1149 无酶无菌水 -
M70194 N,N′-亚甲基双丙烯酰胺 ≥99%,电泳级
PS0008 丙烯酰胺/甲叉溶液 30%,29:1
PS1137 过硫酸铵 10%
T20005 TEMED ≥99.5%,生物技术级,适用于电泳
B10006 白蛋白 来源于牛血清 ≥97%
B15113 白蛋白 来源于牛血清 ≥98%,low endotoxin,protease free, IgG free, fatty acid free
S20006 氢氧化钠 ≥96%,AR
PS1193 氢氧化钠溶液 0.5M in H2O(2%)